![[Deprecated]](figures/lifecycle-deprecated.svg)
This function was equivalent to running successively tags_df() and
dplyr::select() on a linelist object.
To encourage users to understand what is going on and in order to follow the
software engineering good practice of providing just one way to do a given
task, this function is now deprecated.
Arguments
- x
a
linelistobject- ...
the tagged variables to select, using
dplyr::select()compatible terminology; seetags_names()for default values
Examples
if (require(outbreaks)) {
## dataset we'll create a linelist from
measles_hagelloch_1861
## create linelist
x <- make_linelist(measles_hagelloch_1861,
id = "case_ID",
date_onset = "date_of_prodrome",
age = "age",
gender = "gender"
)
head(x)
## check tagged variables
tags(x)
# DEPRECATED!
select_tags(x, "gender", "age")
# Instead, use:
library(dplyr)
x %>%
tags_df() %>%
select(gender, age)
}
#> Warning: `select_tags()` was deprecated in linelist 1.0.0.
#> ℹ This function is deprecated: use the two step `tags_df()` and
#> `dplyr::select()` process instead
#> gender age
#> 1 f 7
#> 2 f 6
#> 3 f 4
#> 4 m 13
#> 5 f 8
#> 6 m 12
#> 7 m 6
#> 8 m 10
#> 9 m 13
#> 10 f 7
#> 11 f 11
#> 12 f 7
#> 13 m 13
#> 14 f 13
#> 15 m 8
#> 16 f 15
#> 17 f 10
#> 18 f 2
#> 19 m 11
#> 20 m 10
#> 21 f 13
#> 22 f 10
#> 23 f 7
#> 24 m 4
#> 25 f 12
#> 26 m 7
#> 27 m 5
#> 28 f 10
#> 29 m 13
#> 30 f 11
#> 31 f 9
#> 32 m 7
#> 33 f 7
#> 34 m 11
#> 35 f 13
#> 36 m 11
#> 37 m 13
#> 38 <NA> 12
#> 39 m 10
#> 40 m 13
#> 41 m 12
#> 42 f 4
#> 43 m 2
#> 44 m 10
#> 45 m 7
#> 46 m 13
#> 47 f 11
#> 48 f 3
#> 49 m 10
#> 50 f 6
#> 51 m 4
#> 52 m 13
#> 53 m 6
#> 54 m 4
#> 55 f 11
#> 56 m 8
#> 57 m 3
#> 58 m 9
#> 59 f 10
#> 60 m 2
#> 61 f 5
#> 62 m 14
#> 63 m 12
#> 64 m 7
#> 65 m 2
#> 66 f 5
#> 67 f 11
#> 68 f 2
#> 69 m 1
#> 70 m 13
#> 71 f 10
#> 72 f 10
#> 73 f 11
#> 74 f 10
#> 75 m 13
#> 76 m 2
#> 77 f 8
#> 78 f 11
#> 79 f 5
#> 80 m 12
#> 81 m 12
#> 82 m 8
#> 83 f 10
#> 84 m 6
#> 85 f 5
#> 86 f 3
#> 87 f 12
#> 88 f 10
#> 89 f 3
#> 90 m 11
#> 91 f 4
#> 92 f 2
#> 93 m 8
#> 94 f 4
#> 95 m 1
#> 96 m 2
#> 97 m 10
#> 98 m 3
#> 99 m 5
#> 100 m 12
#> 101 f 7
#> 102 m 12
#> 103 <NA> 12
#> 104 m 5
#> 105 m 3
#> 106 m 4
#> 107 f 12
#> 108 m 6
#> 109 f 6
#> 110 m 3
#> 111 m 12
#> 112 m 10
#> 113 f 0
#> 114 <NA> 13
#> 115 f 11
#> 116 m 8
#> 117 m 14
#> 118 f 2
#> 119 f 0
#> 120 m 1
#> 121 m 10
#> 122 f 1
#> 123 f 1
#> 124 m 3
#> 125 f 2
#> 126 <NA> 5
#> 127 m 1
#> 128 m 5
#> 129 f 4
#> 130 f 12
#> 131 m 1
#> 132 m 11
#> 133 f 2
#> 134 m 13
#> 135 m 2
#> 136 f 13
#> 137 f 10
#> 138 <NA> 11
#> 139 <NA> 13
#> 140 <NA> 2
#> 141 f 4
#> 142 m 5
#> 143 f 11
#> 144 m 2
#> 145 f 8
#> 146 f 4
#> 147 f 0
#> 148 f 13
#> 149 m 4
#> 150 m 0
#> 151 f 2
#> 152 f 4
#> 153 f 10
#> 154 f 6
#> 155 m 13
#> 156 m 8
#> 157 f 4
#> 158 f 3
#> 159 f 2
#> 160 f 0
#> 161 f 6
#> 162 f 6
#> 163 f 1
#> 164 m 3
#> 165 m 2
#> 166 m 1
#> 167 m 0
#> 168 m 1
#> 169 m 4
#> 170 m 10
#> 171 m 0
#> 172 f 3
#> 173 m 6
#> 174 f 3
#> 175 m 2
#> 176 <NA> 0
#> 177 f 8
#> 178 m 4
#> 179 f 1
#> 180 m 10
#> 181 f 10
#> 182 m 13
#> 183 m 4
#> 184 <NA> 13
#> 185 m 3
#> 186 <NA> 6
#> 187 m 0
#> 188 <NA> 1