Matrices de contact
- Les matrices de contact quantifient les schémas de mélange entre différents groupes de population.
-
socialmixrfournit des outils pour estimer les matrices de contact à partir de données d’enquête - Les matrices de contact peuvent être utilisées dans diverses analyses épidémiologiques, qu’il s’agisse du du calcul de \(R_0\) à la modélisation des interventions.
- Une normalisation adéquate est cruciale lors de l’utilisation des matrices de contact dans les modèles de transmission.
Simulation de la transmission
- Les trajectoires de la maladie peuvent être générées à l’aide du
package
{epidemics}de R. - L’incertitude devrait être incluse dans les trajectoires du modèle en utilisant une gamme de valeurs des paramètres du modèle.
Modélisation des interventions
- L’effet des NPI peut être modélisé comme une réduction des taux de contact entre les groupes d’âge ou une réduction du taux de transmission de l’infection.
- La vaccination peut être modélisée en supposant que les individus passent à un état pathologique différent. \(V\)