Función que genera la tabla con la incidencia según la distribución geográfica.
Argumentos
- data_agrupada
Un `data.frame` que contiene los datos de la enfermedad o evento agrupados por departamento o municipio.
- col_geo
Un `character` (cadena de caracteres) con el nombre de la columna que contiene los nombres de los departamentos o municipios en los datos agrupados de la enfermedad o evento; su valor por defecto es `NULL`.
Ejemplos
# \donttest{
data(dengue2020)
data_limpia <- limpiar_data_sivigila(data_event = dengue2020)
data_agrupada <- agrupar_mpio(data_limpia, dpto = "Antioquia")
incidencia_mpios <- calcular_incidencia_geo(
data_agrupada =
data_agrupada,
ruta_dir = tempdir()
)
#> Las incidencias se calcularon con la poblacion a riesgo definida por el Ministerio de Salud para el 2020
plot_tabla_incidencia_geo(
data_agrupada = incidencia_mpios$data_incidencia,
col_geo = "municipio_ocurrencia"
)
#> <table class="table" style="width: auto !important; margin-left: auto; margin-right: auto;">
#> <caption>Incidencia por geografía de ocurrencia por 100000 habitantes</caption>
#> <thead>
#> <tr>
#> <th style="text-align:center;color: white !important;background-color: rgba(34, 116, 187, 255) !important;"> Código </th>
#> <th style="text-align:center;color: white !important;background-color: rgba(34, 116, 187, 255) !important;"> Municipio </th>
#> <th style="text-align:center;color: white !important;background-color: rgba(34, 116, 187, 255) !important;"> Incidencia </th>
#> </tr>
#> </thead>
#> <tbody>
#> <tr>
#> <td style="text-align:center;"> 05809 </td>
#> <td style="text-align:center;"> Titiribi </td>
#> <td style="text-align:center;"> 9.33 </td>
#> </tr>
#> <tr>
#> <td style="text-align:center;"> 05591 </td>
#> <td style="text-align:center;"> Puerto Triunfo </td>
#> <td style="text-align:center;"> 5.27 </td>
#> </tr>
#> <tr>
#> <td style="text-align:center;"> 05659 </td>
#> <td style="text-align:center;"> San Juan De Uraba </td>
#> <td style="text-align:center;"> 4.77 </td>
#> </tr>
#> <tr>
#> <td style="text-align:center;"> 05736 </td>
#> <td style="text-align:center;"> Segovia </td>
#> <td style="text-align:center;"> 2.54 </td>
#> </tr>
#> <tr>
#> <td style="text-align:center;"> 05490 </td>
#> <td style="text-align:center;"> Necocli </td>
#> <td style="text-align:center;"> 2.27 </td>
#> </tr>
#> <tr>
#> <td style="text-align:center;"> 05129 </td>
#> <td style="text-align:center;"> Caldas </td>
#> <td style="text-align:center;"> 1.48 </td>
#> </tr>
#> <tr>
#> <td style="text-align:center;"> 05045 </td>
#> <td style="text-align:center;"> Apartado </td>
#> <td style="text-align:center;"> 0.78 </td>
#> </tr>
#> <tr>
#> <td style="text-align:center;"> 05837 </td>
#> <td style="text-align:center;"> Turbo </td>
#> <td style="text-align:center;"> 0.77 </td>
#> </tr>
#> <tr>
#> <td style="text-align:center;"> 05001 </td>
#> <td style="text-align:center;"> Medellin </td>
#> <td style="text-align:center;"> 0.16 </td>
#> </tr>
#> </tbody>
#> </table>
# }