Notas de la instructora
Instructor notes
Acceder a las distribuciones de retrasos epidemiológicos
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El objetivo de la evaluación anterior es valorar la interpretación de un tiempo de generación mayor o menor.
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Un elemento interesante del contenido anidado es el
method_assess
, que se refiere a los métodos utilizados por
los autores del estudio para evaluar el sesgo al estimar la distribución
del intervalo serial.
R
covid_serialint$method_assess
SALIDA
$censored
[1] TRUE
$right_truncated
[1] TRUE
$phase_bias_adjusted
[1] FALSE
¡Exploraremos estos conceptos en los siguientes episodios!
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En el contexto de las interfaces de usuario y de las interfaces gráficas de usuario (GUI), como el Zoo de la Distribución una aplicación deslizador es un elemento de control gráfico que permite a los usuarios ajustar un valor moviendo la barra. Conceptualmente, proporciona una forma de seleccionar un valor numérico dentro de un rango especificado deslizando o arrastrando visualmente un puntero (el tirador) a lo largo de un eje continuo.
Cuantificar la transmisión
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Este tutorial muestra el uso de la función epinow()
para
estimar el número de reproducción variable en el tiempo y los tiempos de
infección, las entradas necesarias para el modelo y las limitaciones de
su resultado.
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Consulta la distribución de probabilidad a priori y la probabilidad posterior.
En la “Expected change in daily cases
”
por “la probabilidad posterior de que \(R_t
< 1\)”, nos referimos específicamente a la área bajo la
curva de distribución de probabilidad po.
Utilizar distribuciones de retraso en el análisis
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El acceso a la documentación de referencia (archivos de ayuda) de
estas funciones es accesible con la notación de tres dobles puntos:
epiparameter:::
?epiparameter:::density.epidist()
?epiparameter:::cdf.epidist()
?epiparameter:::quantile.epidist()
?epiparameter:::generate.epidist()
Crear una previsión a corto plazo
Estimación de la severidad del brote
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Los periodos de tiempo son relevantes: Periodo 1 – 15 días en los que el CFR es cero para indicar que no se han notificado muertes; Periodo del 15 de marzo – 26 de abril en el que el CFR parece aumentar; Periodo del 30 de abril – 30 de mayo en el que la estimación del CFR se estabiliza.
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Podemos mostrar este sesgo utilizando la función concepto
descrito en esta viñeta del paquete{cfr}
.