Notas de la instructora

Instructor notes

Acceder a las distribuciones de retrasos epidemiológicos


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El objetivo de la evaluación anterior es valorar la interpretación de un tiempo de generación mayor o menor.



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Un elemento interesante del contenido anidado es el method_assess, que se refiere a los métodos utilizados por los autores del estudio para evaluar el sesgo al estimar la distribución del intervalo serial.

R

covid_serialint$method_assess

SALIDA

$censored
[1] TRUE

$right_truncated
[1] TRUE

$phase_bias_adjusted
[1] FALSE

¡Exploraremos estos conceptos en los siguientes episodios!



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En el contexto de las interfaces de usuario y de las interfaces gráficas de usuario (GUI), como el Zoo de la Distribución una aplicación deslizador es un elemento de control gráfico que permite a los usuarios ajustar un valor moviendo la barra. Conceptualmente, proporciona una forma de seleccionar un valor numérico dentro de un rango especificado deslizando o arrastrando visualmente un puntero (el tirador) a lo largo de un eje continuo.



Cuantificar la transmisión


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Este tutorial muestra el uso de la función epinow() para estimar el número de reproducción variable en el tiempo y los tiempos de infección, las entradas necesarias para el modelo y las limitaciones de su resultado.



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Consulta la distribución de probabilidad a priori y la probabilidad posterior.

En la Expected change in daily cases por “la probabilidad posterior de que \(R_t < 1\)”, nos referimos específicamente a la área bajo la curva de distribución de probabilidad po.



Utilizar distribuciones de retraso en el análisis


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El acceso a la documentación de referencia (archivos de ayuda) de estas funciones es accesible con la notación de tres dobles puntos: epiparameter:::

  • ?epiparameter:::density.epidist()
  • ?epiparameter:::cdf.epidist()
  • ?epiparameter:::quantile.epidist()
  • ?epiparameter:::generate.epidist()


Estimación de la severidad del brote


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Los periodos de tiempo son relevantes: Periodo 1 – 15 días en los que el CFR es cero para indicar que no se han notificado muertes; Periodo del 15 de marzo – 26 de abril en el que el CFR parece aumentar; Periodo del 30 de abril – 30 de mayo en el que la estimación del CFR se estabiliza.



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Podemos mostrar este sesgo utilizando la función concepto descrito en esta viñeta del paquete{cfr}.