Analyse et prévisions en temps réel des épidémies avec R: Points clés

Accéder aux distributions des retards épidémiologiques

Utilisez epiparameter pour accéder au catalogue des distributions de retards épidémiologiques.
Utilisez cette fonction pour accéder au catalogue de la littérature sur les distributions de délais épidémiologiques. epiparameter_db() pour sélectionner une seule distribution de délais.
Utilisez cette option pour sélectionner les distributions à retard unique. parameter_tbl() pour obtenir une vue d’ensemble des distributions de délais multiples.
Réutiliser les estimations connues pour une maladie inconnue au début d’une épidémie lorsqu’il n’y a pas de données sur la recherche des contacts.

Les paramètres de transmission peuvent être estimés à partir des données du cas après prise en compte des retards.
L’incertitude peut être prise en compte dans la distribution des retards.

Utilisez les fonctions de distribution avec <epiparameter> pour obtenir des statistiques sommaires et des paramètres informatifs pour les interventions de santé publique, comme la fenêtre de recherche des contacts et la durée de la quarantaine.
Utilisez discretise() pour convertir les distributions de délais continues en distributions discrètes.
Utilisez epiparameter pour obtenir les délais de déclaration requis dans les estimations de transmissibilité.